敦煌研究院时期（1984-现在）

1984年8月 敦煌文物研究所扩建为敦煌研究院。常书鸿任名誉院长，段文杰任院长。

1986年3月 榆林窟文物保管所成立。同年8月，经甘肃省文化厅批准，榆林窟文物保管所由敦煌研究院代为管理。

1987年12月 联合国教科文组织世界遗产委员会将敦煌莫高窟列入世界文化遗产名录。

1995年 敦煌研究院获文化部、国家人事部授予的“全国文化先进集体”称号。

1997年 西千佛洞文物保管所成立。

1998年 敦煌研究院获国家文物局、国家建设部、中国联合国教科文组织全委会授予的“中国世界遗产保护管理先进单位”荣誉称号。

1998年4月 段文杰任敦煌研究院名誉院长，樊锦诗任敦煌研究院院长。

2003年3月 《甘肃省敦煌莫高窟保护条例》实施。

2014年12月 樊锦诗任敦煌研究院名誉院长，王旭东任敦煌研究院院长。

2016年12月 甘肃省人民政府决定，将由甘肃省文物局管理的天水麦积山石窟艺术研究所、永靖炳灵寺石窟文物保护研究所、庆阳北石窟寺文物保护研究所整建制划归敦煌研究院统一管理。

2017年1月 敦煌研究院被评为“国家一级博物馆”。

2018年 敦煌研究院建立并实施全面质量管理体系建设。9月获亚洲质量创新奖。10月获第三届中国质量奖。

2018年12月 成立保护研究部、人文研究部、艺术研究部、文化弘扬部四大业务主管部门,统筹协调和管理 14个业务部门。

2019年5月 王旭东调任故宫博物院院长，赵声良任敦煌研究院院长。

2019年8月 习近平总书记视察敦煌研究院，并在敦煌研究院主持召开座谈会，发表重要讲话。

2020年1月 敦煌研究院获中共中央宣传部授予的文物保护利用群体“时代楷模”称号。同时，获中共甘肃省委宣传部授予的“感动甘肃·陇人骄子”称号。

2021年8月 赵声良任党委书记，苏伯民任敦煌研究院院长。